中央研究院基因體研究中心 大數據分析實驗室

The Big Data Analysis Lab.

(especially focus on genomics/transcriptomics  analysis of human, Chimpanzee 黑猩猩, and other primates)

Dr.莊樹諄 研究員/教授生活的樂趣,在於創造希望

Trees-Juen Chuang Ph.D. (Research Fellow/Professor)Hope

Genomics Research Center, Academia Sinica, Taipei, Taiwan

 

E-mail: trees@gate.sinica.edu.tw  

 

Research directions:

Bioinformatics, Comparative & Evolutionary Genomics, Post-transcriptional Regulation, Systems Biology, Primate Evolution, Genomic Imprinting生物資訊、比較與演化基因體學、後轉錄調控、系統生物學、靈長類動物演化、基因印記。

Publications (論文發表)      Member (實驗室成員)

本實驗室是一堅強的大數據分析實驗室,包含資訊、統計、與分生實驗三個部分。我們以生物的觀點,資訊人的思維,解決純生物的問題。成立於2003年10月,指導老師為Prof. 莊樹諄

大數據分析是一門整合了資訊科學、統計學、與生命科學的跨領域研究。我們藉由設計演算法來分析新世代定序(NGS)資料,以資訊邏輯與數學運算將data轉換成information,配合統計分析篩選targets,之後輔以分生實驗驗證,並進一步實驗探討功能與機制,真正將information轉換成knowledge。我們的研究流程: data-->information-->knowledge。本實驗室致力於基因體(DNA level)和轉錄體(RNA level)跨物種間比較與演化等生物相關研究課題,特別著重於探討靈長類動物在後轉錄修飾如多樣性切割(Alternative Splicing包含trans-splicing、circular RNA、以及其他non-coding RNA)、RNA editing等。應用: 找出影響神經發育或退化相關疾病因子,目前focus on autism spectrum disorders(ASD,自閉症)。

歡迎有志於學術研究的同學加入我們,組成堅強的台灣團隊,共同挑戰未知、超越自我、台灣發光、放射國際

Education & Position:

B.S., Department of Computer Science, Soochow University, 1988~1992.

Ph.D., Institute of Computer & Information Science, National Chiao Tung University (NCTU), 1992~1998 (直攻博士).

Post-doctoral fellow, Institute of Biomedical Sciences, Academia Sinica, 1998~2003 (military service 國防役).

Assistant Research Fellow, Genomics Research Center, Academia Sinica, 2003~2007.

Associate Research Fellow, Genomics Research Center, Academia Sinica, 2007~2014.

Research Fellow, Genomics Research Center, Academia Sinica, 2014~

台灣大學基因體與系統生物學學位學程合聘教授

師範大學生命科學系合聘教授

陽明大學基因體科學學程兼任教授

國防醫學院生命科學研究所兼任教授

亞洲大學生物技術與生物資訊系合聘教授

 

Honor:
Year Award
2014 科技部優秀年輕學者計畫 (Project for Excellent Junior Research Investigators Award, Ministry of Science and Technology)
2012 Pius XI Medal (awarded by the Pontifical Academy of Sciences, Vatican, 2012)
2007 中研院年輕學者研究著作獎 (Academia Sinica Research Award for Junior Research Investigators, 2007)
2007 國科會吳大猷先生紀念獎 (Wu Ta-Yuo Memorial Award, National Science Council, 2007)
2001 國家衛生研究院 博士後研究學者獎(Postdoctoral Researcher Award of National Health Research Institutes (NHRI), 2001)
1999 Academia Sinica Post-doctoral Fellowship, 1999-2000
1998 中華民國影像處理暨圖樣識別學會(IPPR)、中華民國影像處理及多媒體應用廠商聯誼會佳作論文獎 (Academic Paper Awards of the Image Processing and Pattern Recognition Society, 1998)

 

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 

Homepage maintained by Ms. Min_Chin Hsu (徐銘璟)

Last update: January 21, 2017